Bazel 系統是以長期伺服器程序的形式導入。藉此執行批次導向的多項最佳化作業，例如從一個版本快取 BUILD 檔案、依附元件圖表和其他中繼資料到下一個版本。這樣做可以改善漸進式建構的速度，並允許不同的指令 (例如 build 和 query) 共用已載入套件的快取，讓查詢得以快速執行。
執行 bazel 時，您正在執行用戶端。用戶端會根據輸出基礎尋找伺服器，根據預設，取決於基本工作區目錄和您的使用者 ID。因此，如果您建立了多個工作區，就會有多個輸出集，因此有多個 Bazel 伺服器程序。同一工作站上的多位使用者可以在同一個工作區中同時建構，因為其輸出集會有所不同 (不同的使用者 ID)。
如果用戶端找不到執行中的伺服器執行個體，就會啟動新的執行個體。方法是檢查輸出基礎是否存在，暗示隱密的封存已經解壓縮。如果輸出基底不存在，用戶端會解壓縮封存檔，並將 mtime 設為未來 9 年。安裝完成後，用戶端會確認未壓縮檔案的 mtime 等於最遠的項目，以確保不會發生安裝竄改行為。
伺服器程序會在閒置一段時間後 (預設為 3 小時，使用啟動選項 --max_idle_secs 修改) 並停止伺服器；最重要的是，使用者無法看到執行中的伺服器，不過在某些情況下，這樣做會有所幫助。例如，如果您要執行的指令碼是在不同的目錄中執行大量自動化建構，請務必確保這些伺服器不會花費大量的閒置伺服器，方法是在伺服器結束時加以關閉，或是指定較短的逾時期間。
Bazel 伺服器程序的名稱在 ps x 或 ps -e f 的輸出內容中顯示為 bazel(dirname)，其中「dirname」是內含工作區目錄根目錄的目錄基本資訊名稱。例如：
ps -e f
16143 ? Sl 3:00 bazel(src-johndoe2) -server -Djava.library.path=...
這樣就能輕鬆辨別哪個伺服器程序屬於特定工作區。(請注意，除了 ps 以外的特定選項，Bazel 伺服器程序可能只會命名為 java)。您可以使用 off 指令停止 Bazel 伺服器。
執行 bazel 時，用戶端會先檢查伺服器是否為正確版本；如果沒有，則系統會停止伺服器並啟動新的伺服器。這可以確保使用長時間執行的伺服器程序不會幹擾適當的版本。